Östrogen wird hauptsächlich in den Eierstöcken (Ovarien) gebildet. Bei Frauen in der Prämenopause sind die Eierstöcke die primäre Quelle dieses Hormons. Während der Schwangerschaft produziert auch die Plazenta erhebliche Mengen an Östrogen. In geringeren Mengen wird Östrogen auch in den Nebennieren und im Fettgewebe produziert.