Der Hauptbestandteil eines Gels für die Elektrophorese, das in Platten gegossen wird, ist in der Regel Agarose oder Polyacrylamid. Agarose-Gele werden häufig für die Trennung von DNA-Fragmenten verwendet, während Polyacrylamid-Gele oft für die Trennung von Proteinen oder kleineren DNA-Fragmenten genutzt werden.