Progesteron wird hauptsächlich in den Eierstöcken, genauer gesagt im Gelbkörper (Corpus luteum), gebildet. Während der Schwangerschaft wird Progesteron auch in großen Mengen von der Plazenta produziert. In geringeren Mengen wird es zudem in den Nebennierenrinden beider Geschlechter und in den Hoden bei Männern produziert.