Das Mikrobiom im Darm befindet sich hauptsächlich im Dickdarm (Kolon), wo dieichte und Vielfalt der Mikroben am höchsten ist. Es gibt jedoch auch eine Vielzahl von Mikroben im Dünndarm, insbesondere im oberen Teil, obwohl die Anzahl dort geringer ist. Das Mikrobiom spielt eine entscheidende Rolle für die Verdauung, das Immunsystem und die allgemeine Gesundheit.