Das Y-Chromosom ist mit bestimmten Krebsarten assoziiert, insbesondere mit Prostatakrebs. Studien haben gezeigt, dass Veränderungen oder Verluste des Y-Chromosoms in somatischen Zellen bei Männern mit einem erhöhten Risiko für Prostatakrebs und möglicherweise auch für andere Krebsarten wie Blasenkrebs in Verbindung gebracht werden können.