Die genannten Rechnungen wurden leider nie von Ihrer Seite abbgebucht, daher buchen wir diese mit etwas Verspätung ab.

Eine freundliche Formulierung könnte wie folgt aussehen: "Leider mussten wir feststellen, dass die oben genannten Rechnungen von Ihrer Seite bisher nicht abgebucht wurden. Daher werden wir diese Rechnungen mit etwas Verspätung abbuchen. Vielen Dank für Ihr Verständnis."