Anaerobe Pellets können Schwefelverbindungen enthalten, insbesondere in Form von Schwefelwasserstoff (H₂S), der durch den Abbau organischer Materie unter anaeroben Bedingungen entsteht. Schwefel ist ein wesentliches Element im anaeroben Abbauprozess, da bestimmte Bakterien Schwefelverbindungen als Elektronenakzeptoren nutzen.