Blaualgen werden so genannt, weil sie eine bläuliche Farbe aufweisen, die durch das Pigment Phycocyanin verursacht wird. Diese Mikroorganismen gehören eigentlich zu den Cyanobakterien, die photosynthetisch aktiv sind und in vielen Gewässern vorkommen. Der Begriff "Blaualgen" ist also etwas irreführend, da es sich nicht um echte Algen handelt, sondern um Bakterien, die ähnliche Eigenschaften wie Algen aufweisen.