Ein Wasserstoffmotor, der Wasserstoff als Kraftstoff nutzt, produziert hauptsächlich Wasserdampf als Abgas. Bei der Verbrennung von Wasserstoff mit Sauerstoff entsteht Wasser (H2O) als Hauptprodukt. In einigen Fällen können auch geringe Mengen an Stickoxiden (NOx) entstehen, insbesondere wenn hohe Temperaturen erreicht werden, da diese Bedingungen die Bildung von NOx begünstigen. Im Vergleich zu fossilen Brennstoffen hat ein Wasserstoffmotor jedoch deutlich geringere Emissionen und ist somit umweltfreundlicher.