Vancomycin wird bei Clostridium difficile-Infektionen oral verabreicht, weil es bei oraler Einnahme direkt im Darm wirkt. Bei intravenöser Gabe würde das Medikament hauptsächlich im Blut zirkulieren und nicht in ausreichenden Mengen im Darm ankommen, wo die Clostridium difficile-Bakterien sich befinden. Die orale Formulierung ermöglicht eine höhere lokale Konzentration des Antibiotikums im Darm, was effektiver zur Bekämpfung der Infektion beiträgt.