Rektoskope werden in der Regel als semikritische Medizinprodukte eingestuft. Semikritische Produkte sind solche, die mit Schleimhäuten oder intakter Haut in Kontakt kommen, jedoch nicht mit durch Blut oder andere Körperflüssigkeiten kontaminierten Bereichen. Da Rektoskope in den Enddarm eingeführt werden und somit mit Schleimhäuten in Kontakt kommen, müssen sie nach der Anwendung gründlich desinfiziert und sterilisiert werden, um das Risiko von Infektionen zu minimieren.