Der Wasserstoff-Atemtest wird häufig verwendet, um Laktoseintoleranz und bakterielle Fehlbesiedlung des Dünndarms (SIBO) nachzuweisen. Bei diesen Erkrankungen führt die Fermentation von unverdauten Kohlenhydraten durch Bakterien im Darm zu einer erhöhten Produktion von Wasserstoff, der dann in der Ausatemluft gemessen werden kann.