Ich wollte nicht in deinen Kompetenzbereich eingreifen, es gab offensichtlich ein Missverständnis. Ich wünsche dir trotzdem einen schönen Urlaub.

Du könntest deine Nachricht folgendermaßen formulieren: "Ich möchte klarstellen, dass ich nicht in deinen Kompetenzbereich eingreifen wollte. Es scheint, dass es ein Missverständnis gegeben hat. Ich wünsche dir dennoch einen schönen Urlaub!" Diese Formulierung ist höflich und respektvoll und vermittelt deine Absicht klar.