Das natürliche oder organische Äquivalent zu Benzoylperoxid das häufig zur Behandlung von Akne wird, ist Teebaumöl. Teebaumöl hat antimikrobielle Eigenschaften und kann helfen Akne verursachende Bakter zu bekämpfen. Ein weiteres alternatives Mittel ist Salicylsäure, die ebenfalls in pflanzlichen Quellen wie Weidenrinde vorkommt und entzündungshemmende sowie exfolierende Eigenschaften hat. Diese natürlichen Alternativen können weniger reizend sein als Benzoylperoxid, wirken jedoch möglicherweise nicht bei jedem gleich effektiv.