Pektin kommt vor allem in den Zellwänden von Pflanzen vor, insbesondere in Früchten. Es ist ein wichtiger Bestandteil von Obstsorten wie Äpfeln, Zitrusfrüchten (z.B. Orangen und Zitronen), Birnen und Pflaumen. Pektin wird häufig in der Lebensmittelindustrie als Geliermittel in Marmeladen, Gelees und anderen Produkten verwendet. Auch in einigen Gemüsesorten wie Karotten und Rüben ist Pektin enthalten.