Ein Nachteil von Brennstoffzellen im Alltag ist die begrenzte Infrastruktur für die Betankung, insbesondere im Vergleich zu herkömmlichen Kraftstoffen oder Elektroautos. Zudem können die Kosten für die Herstellung und den Betrieb von Brennstoffzellen höher sein, und die Speicherung von Wasserstoff erfordert spezielle Sicherheitsvorkehrungen. Auch die Effizienz der Wasserstoffproduktion kann problematisch sein, wenn sie nicht aus erneuerbaren Quellen stammt.