In Acyl-CoA und Acetyl-CoA ist die Thioesterbindung zwischen dem Coenzym A (CoA) und der Acylgruppe vorhanden. Diese Bindung ist eine energiereiche Verbindung, die es ermöglicht, dass die Acylgruppe in verschiedene biochemische Reaktionen, wie z.B. die Fettsäuresynthese oder den Fettsäureabbau, übertragen wird. Im Fall von Acetyl-CoA ist die Acylgruppe die Acetylgruppe (C2), und die Thioesterbindung befindet sich zwischen dem Schwefelatom des CoA und dem Carbonylkohlenstoff der Acetylgruppe. Diese Struktur ist entscheidend für viele metabolische Prozesse in der Zelle.