Cis- und Trans-Konfigurationen sind spezifische Begriffe, die sich auf die räumliche Anordnung von Atomen oder Gruppen um eine Doppelbindung beziehen. Bei Einfachbindungen, wie sie in gesättigten Fettsäuren vorkommen, gibt es keine cis- oder trans-Isomerie, da die Atome um eine Einfachbindung frei rotieren können. Daher sind cis- und trans-Konfigurationen nur bei Molekülen mit Doppelbindungen relevant.