Im Rahmen der Transkriptionsregulation bezieht sich der Begriff "cisregulatorische Elemente" auf DNA-Sequenzen, die sich in der Nähe des Gens befinden, das sie regulieren. Diese Elemente sind oft in Promotoren oder Enhancern zu finden und dienen als Bindungsstellen für Transkriptionsfaktoren, die die Transkription des Gens aktivieren oder repressieren können. Beispiele für cisregulatorische Elemente sind TATA-Boxen, CAAT-Boxen und spezifische Bindungsstellen für Transkriptionsfaktoren. Trans-regulatorische Faktoren hingegen sind Proteine, die von anderen Genen kodiert werden und die Fähigkeit haben, an cisregulatorische Elemente zu binden. Diese Faktoren können sowohl aktivierend (z. B. Aktivatoren) als auch repressiv (z. B. Repressoren) wirken. Sie beeinflussen die Transkription eines Gens, indem sie die Interaktion zwischen der RNA-Polymerase und dem Promotor des Gens modulieren. Zusammengefasst: Cisregulatorische Elemente sind DNA-Sequenzen in der Nähe eines Gens, während trans-regulatorische Faktoren Proteine sind, die von anderen Genen stammen und die Aktivität dieser cisregulatorischen Elemente beeinflussen.