Die prokaryotischen Homologe zu den eukaryotischen Hsp104 und Hsp110 sind hauptsächlich die Chaperone der Hsp70-Familie und die Clp-Proteasen. In Bakterien sind insbesondere die ClpB-Proteine alsologe zu H104 bekannt, da sie eine ähnliche Funktion in der Proteinfaltung und -aggregation haben. Hsp110 hat prokaryotische Homologe wie DnaK, das ebenfalls zur Hsp70-Familie gehört und eine Rolle bei der Proteinfaltung und der Stressantwort spielt. Diese Chaperone sind entscheidend für die Aufrechterhaltung der Proteinhomöostase unter Stressbedingungen.