Der Hauptnachteil des Merkantilismus war, dass er auf eine starke staatliche Kontrolle und Regulierung der Wirtschaft setzte, was oft zu Ineffizienzen und Verzerrungen führte. Insbesondere förderte er den Protektionismus, der den internationalen Handel einschränkte und die Entwicklung einer wettbewerbsfähigen Wirtschaft behinderte. Zudem konzentrierte sich der Merkantilismus stark auf die Anhäufung von Gold und Silber, was langfristig zu wirtschaftlichen Ungleichgewichten und Spannungen zwischen den Nationen führte.