GoodNotes speichert die Dateien standardmäßig lokal auf dem iPad. Die Notizen und Dokumente werden in der App selbst verwaltet und sind nicht direkt im Dateisystem des iPads sichtbar. Du kannst jedoch die Dateien über die iCloud oder andere Cloud-Dienste synchronisieren, wenn du diese Funktion aktivierst. Dadurch hast du die Möglichkeit, auf deine Notizen von verschiedenen Geräten aus zuzugreifen.