Mendel 3 unterscheidet sich von Mendel 1 und 2 in mehreren Aspekten, die sich auf die Funktionalität und die Benutzeroberfläche beziehen. Während die ersten beiden Versionen grundlegende Funktionen zur Analyse von genetischen Daten bieten, bringt Mendel 3 erweiterte Analysewerkzeuge, eine verbesserte Benutzeroberfläche und zusätzliche Funktionen zur Visualisierung von Daten mit. Zudem könnte Mendel 3 eine bessere Integration mit anderen Softwarelösungen und eine optimierte Performance aufweisen. Die genauen Unterschiede hängen jedoch von den spezifischen Versionen und deren Updates ab.