Die Größe von Kristallen in Tonmineralen kann stark variieren, typischerweise liegen sie jedoch im Mikrometerbereich. Die Kristalle sind oft sehr klein und können von wenigen Mikrometern bis zu einigen Millimetern reichen. Die Anzahl der Elementarschichten in einem Kristall hängt von der spezifischen Struktur des Tonminerals ab. In der Regel bestehen Tonminerale aus mehreren Schichten, die sich wiederholen. Diese Schichten können aus wenigen bis zu mehreren Dutzend Elementarschichten bestehen. Bei den häufigsten Tonmineralen, wie z.B. Montmorillonit oder Illit, können die Schichten in der Größenordnung von 1 bis 10 Elementarschichten liegen. Zusammenfassend kann man sagen, dass die Kristalle von Tonmineralen meist mikroskopisch klein sind und die Anzahl der Elementarschichten je nach Mineraltyp variiert.