Bt-Baumwolle gibt das Bt-Protein nicht an die Nachkommen weiter, wenn die Pflanze nicht gentechnisch verändert wurde oder wenn die genetische Modifikation, die das Bt-Protein produziert, nicht stabil in die Keimbahn integriert ist. Dies kann durch verschiedene Faktoren verursacht werden, wie z.B. durch unvollständige oder fehlerhafte genetische Transformation oder durch genetische Segregation in nachfolgenden Generationen.